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军舰旗是舰船表示所属海军的旗帜。英语是Naval Ensign（直译为海军旗）。政府船只及商船等不会悬挂军舰旗，因这是根据军舰特权的限制。与陆军所使用的军旗（日本会每一个连队(<noinclude>)授予一面连队旗）差不多，但在国际法上使用及赋予的地位则不大相同。军舰旗在战斗时也会作战斗旗使用，同时，与这个不同的国籍旗(<noinclude>、Naval Jack)亦需在指定场合使用。由于各国的法制不同，因此以下的军舰旗有机会同是海军旗