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本书之注疏不少。中国方面有智圆《金刚錍科》一卷、《金刚錍显性录》四卷，以及姓《金刚錍私记》二卷、善月《金刚錍义解》三卷（现存中卷一卷）、仁岳《金刚錍科》一卷、可观《金錍论义》一卷、时举《金錍论释文》三卷等。日本方面有最澄《注金錍论》一卷、证真《金刚錍论私记》一卷、经历《金刚錍论记》二卷（写本）、凤潭《金刚錍论逆流批》三卷、慧澄《开讲要义》等。